成功的實(shí)驗(yàn)都是相似的,不成功的實(shí)驗(yàn)則各有各的不幸。說起Western blotting,原理雖然簡單,但個(gè)中甜酸苦辣,只有自己才知道。對于成功的Western blotting而言,關(guān)鍵因素有很多:一抗、二抗、轉(zhuǎn)印、顯色。膜,卻往往被忽略,常常是,別人用什么,我也用什么;實(shí)驗(yàn)室有什么,我就用什么。但每個(gè)人的研究對象不同,適合別人的未必適合你。
在選擇膜時(shí),我們要考慮兩個(gè)關(guān)鍵因素:膜的類型和孔徑大小。在你決定了這兩個(gè)因素后,你還可以選擇膜的形式等。Bio-Rad公司實(shí)驗(yàn)室分離部門的全球產(chǎn)品經(jīng)理Thomas Davies是這方面的專家,他提出了一些建議。
PVDF vs. NC
讓我們先來看看Western blotting中*常用的兩種膜:PVDF膜和硝酸纖維素(NC)膜。每一種膜的性質(zhì)不同,也適合不同的實(shí)驗(yàn)條件。讓我們先來看看每一種膜的物理性質(zhì)和性能特點(diǎn)吧。
PVDF膜之所以如此受人歡迎,是因?yàn)樗哂袔讉(gè)關(guān)鍵特性。首先,它帶來了高的機(jī)械強(qiáng)度和耐化學(xué)腐蝕性,因此適合反復(fù)使用(reprobing)。同時(shí),PVDF膜也比NC膜具有更高的結(jié)合能力,150-160 µg/cm2 vs. 80 µg/cm2,這意味著它提供了更高的靈敏度。
由于PVDF的疏水性,這些膜也成為疏水蛋白質(zhì)(如膜蛋白)的。也正因?yàn)槿绱,這種膜需要一個(gè)簡短的甲醇“潤濕”步驟。如果你在熒光blot中選擇PVDF,那么須選擇一種低熒光的PVDF膜,它與標(biāo)準(zhǔn)PVDF膜的特性相同,但自發(fā)熒光極低。
硝酸纖維素膜一度是Western blotting中的,現(xiàn)在也頗受歡迎,因?yàn)榈鞍着c硝酸纖維素的結(jié)合是瞬時(shí)的,幾乎不可逆轉(zhuǎn),而膜很容易水化。
傳統(tǒng)的硝酸纖維素膜不適合反復(fù)使用,也不耐受劇烈的化學(xué)處理。對于這些情況,支持的硝酸纖維素膜是個(gè)更好的選擇。它包含了惰性的支持結(jié)構(gòu),增強(qiáng)膜的強(qiáng)度和韌性。
孔徑大小
選擇膜時(shí)的第二個(gè)考慮是孔徑大小。Western blotting的膜是微孔基質(zhì),可與蛋白結(jié)合;孔的大小決定了哪些蛋白會(huì)成功結(jié)合,而哪些蛋白會(huì)穿過。
Western blotting的膜通常有兩個(gè)孔徑大小。對于大部分實(shí)驗(yàn),0.45 µm的膜是不錯(cuò)的選擇,它適合分子量高于20 kD的蛋白;而0.2 µm的膜更適合小于15 kD的低分子量蛋白。記住一個(gè)原則:如果檢測上樣量低的蛋白,或是定量檢測,那么寧小勿大。
形式
目前市場上有多種包裝形式的膜,讓人眼花繚亂。在選擇這些膜時(shí),你必須考慮到轉(zhuǎn)印系統(tǒng)(半干、濕轉(zhuǎn))、方便性以及價(jià)格等。
• 一大卷,這是*受歡迎的形式,因?yàn)槟さ拿娣e很大(如26 cm x 3.3 m),經(jīng)濟(jì)實(shí)惠。你可以根據(jù)凝膠的大小來切割,相當(dāng)靈活。當(dāng)然,這需要花費(fèi)一些時(shí)間,也會(huì)帶來膜大小的差異。
• 預(yù)切膜,由制造商預(yù)先切好,省時(shí)省力,就是不省錢。很多公司提供各種大小的預(yù)切膜。生物通
• 預(yù)切且預(yù)潤濕的膜。如果高通量、方便性對你很重要,那么這種就是*佳之選。
Western blotting的確有很多不確定的因素,因?yàn)楹茈y控制每個(gè)實(shí)驗(yàn)參數(shù)?刂坪梦覀兯芸刂频,那就離成功又近了一步。
原創(chuàng)作者:上海信帆生物科技有限公司