迎接生物學(xué)的“干”未來

點擊次數(shù)：17261 發(fā)布時間：2014/1/3 15:07:14

多數(shù)生命科學(xué)家正專注于自己的職業(yè)，一個特殊的有機(jī)體或一種疾病，甚至只是一個特定的分子路徑。要學(xué)會培養(yǎng)特殊細(xì)胞類型或一種新實驗室技術(shù)，需要數(shù)月時間。但是，Atul Butte卻并非如此。盡管只有44歲，他已經(jīng)擁有美國斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的終身職位，為肺癌和其他疾病發(fā)明了諸多新藥。

Butte的實驗室也與眾不同。這里并非到處都是培養(yǎng)皿和試劑。他的工具看上去更像屬于一位工程師或軟件開發(fā)者：很多時候，他的工具只是一臺索尼筆記本，盡管當(dāng)需要巨大的計算處理能力時，他也會使用斯坦福大學(xué)的大型計算機(jī)和其他地方的超級計算機(jī)。

與培養(yǎng)細(xì)胞和測序DNA不同，Butte及其學(xué)生和博士后會對裝滿可自由獲取信息的數(shù)據(jù)庫進(jìn)行篩選，例如，人類基因組、腫瘤基因組序列數(shù)據(jù)庫、腦成像資料庫以及糖尿病等疾病的生物標(biāo)示資料等。

許多人稱這樣的研究為“干實驗”，與目前更多親自動手的傳統(tǒng)“濕實驗”形成對比。雖然統(tǒng)計這樣的干實驗科學(xué)家究竟有多少非常困難，但可以肯定他們是人數(shù)不斷增長的少數(shù)派。Butte則是其中的佼佼者。

兩年前，Butte及其同事使用公開數(shù)據(jù)，利用患有100種不同疾病的人群體內(nèi)的基因集，分析了市面上164種藥物處理過的培養(yǎng)細(xì)胞基因活性。然后他們發(fā)現(xiàn)了一些新的、存在于這些基因之間的相互聯(lián)絡(luò)方式。Butte研究小組通過比較患病或用藥情況下基因表達(dá)的開啟情況，發(fā)現(xiàn)了在這些基因之間有意想不到的聯(lián)系。“現(xiàn)在就是做干實驗研究的黃金時期。”Butte總結(jié)道。

“生物學(xué)正在發(fā)生一場大變革。” 美國加州大學(xué)洛杉磯分校神經(jīng)遺傳學(xué)家Daniel Geschwind說。洛杉磯微軟研究院計算機(jī)專家David Heckerman也指出，現(xiàn)在生物學(xué)研究真的可以不需要傳統(tǒng)的“濕”實驗室了。

原創(chuàng)作者：上海信帆生物科技有限公司

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